nCounter | NanoString

CITOGEN offre aux centres de recherche et/ou laboratoires qui souhaitent profiter de la technologie de NanoString, mais ne disposent pas d’équipement pour analyser les échantillons, la possibilité de le faire dans notre laboratoire.

Une fois le projet connu, nos experts vous aideront à choisir le panel le plus approprié pour votre test. En fonction du protocole à appliquer, les échantillons seront traités sur l’équipement adapté et nous vous fournirons les résultats pour qu’ils puissent être analysés.

La plateforme nCounter® de NanoString® est une solution rapide et simple pour l’analyse multiplexée de jusqu’à 800 cibles d’ARN ou de protéines, sans amplification, conversion en ADNc ni préparation de bibliothèques.

 

Pourquoi choisir la plateforme nCounter ?

 

 

 

Gain de temps

 

  • Plus rapide et plus simple que d’autres techniques similaires telles que : qPCR, microarray ou RNA-Seq
  • 15 minutes de procédure manuelle seulement
  • Panels de gènes commerciaux conçus par des experts (possibilité de les personnaliser) pour l’homme et la souris

 

Réduction des erreurs

 

  • Pas de rétrotranscription de l’ARN en ADNc, ni d’amplification préalable, sources potentielles de biais, d’erreurs et de variabilité

 

Économie d'échantillon
  • Protocoles optimisés pour les échantillons complexes (tissu FFPE ou lysats y compris)

Économie de ressources
  • Disponibilité d’outils pour une analyse avancée des données, réduisant ainsi le besoin d’assistance bio-informatique
  • Analyse numérique de l’expression génique, éliminant le besoin de répliques techniques
Excellente reproductibilité
  • Automatisation complète
  • Sensibilité et précision élevées
  • Données quantitatives numériques
  • Assurance qualité (certificat ISO 13485 et conformité aux BPF)

Comment ça marche ?

La technologie nCounter de NanoString est basée sur la détection numérique d’un code-barres moléculaire (avec code couleur) lié à une sonde spécifique (sonde reporter) pour le gène d’intérêt. Vient s’y ajouter une autre sonde spécifique (sonde de capture), reliée à la première de manière covalente, hybride avec la séquence cible pour permettre l’immobilisation du complexe formé par la séquence cible et les sondes.

Par la suite, les sondes non hybridées en trop sont éliminées et les complexes purifiés sont immobilisés et orientés pour le balayage des signaux à l’aide d’un microscope à fluorescence automatique. Les données générées (fichiers CSV) pourront ensuite être analysées avec le logiciel d’analyse gratuit nSolver™ de NanoString.

Quel est le processus ?

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Échange/consultation avec nos experts

Choix du panel

Une grande variété de panels conçus et vérifiés par des experts, aussi bien pour l’ARN que pour les protéines, est à votre disposition. Vous pouvez également les personnaliser.

Choix des échantillons

Réception des données

Panels disponibles

Immunologie
  • Autoimmune Discovery Panel : étude de la relation entre les variantes germinales associées aux maladies auto-immunes et à l’expression des gènes.
  • Autoimmune Profiling Panel : étude des gènes pertinents pour les maladies auto-immunes, les maladies inflammatoires chroniques et les effets indésirables associés à l’immunothérapie (panel pour l’homme et panel pour la souris).
  • Fibrosis Panel : étude des gènes impliqués dans le processus de fibrose.
  • Host Response Panel : étude globale de la réponse immunitaire de l’individu (humain ou souris) face à l’infection.
  • Human Organ Transplant Panel : étude de la réponse immunitaire de l’individu face à l’organe transplanté.
  • Immune Exhaustion Panel : étude de l’expression des gènes impliqués dans l’épuisement des cellules T, B et NK dans divers contextes, cancers et maladies infectieuses y compris.
  • Immunology Panel : étude de l’expression des gènes liés à l’immunologie.
  • Inflammation Panel : étude de la réponse inflammatoire précoce.

Oncologie
  • Breast Cancer 360 Panel : étude de l’expression des gènes impliqués dans la biologie du cancer du sein, micro-environnement et réponse immunitaire y compris.
  • PanCancer Immune Profiling Panel : étude complète de la réponse immunitaire, optimisée pour la recherche en immuno-oncologie, gènes essentiels de la biologie tumorale et du micro-environnement tumoral y compris.
  • PanCancer Immuno-Oncology 360 Panel : étude complète des gènes impliqués dans l’évasion immunitaire tumorale et la réponse aux immunothérapies, gènes essentiels du micro-environnement tumoral et de la réponse immunitaire y compris.
  • PanCancer Pathways Panel : étude complète des gènes impliqués dans les principales voies affectées par le cancer, gènes essentiels du micro-environnement tumoral et de la réponse immunitaire y compris.
  • PanCancer Progression Panel : étude des gènes impliqués dans les processus et mécanismes impliqués dans la progression du cancer, gènes essentiels de la biologie tumorale, du micro-environnement tumoral et de la réponse immunitaire y compris.
  • Tumor Signaling 360 Panel : étude complète des voies de signalisation cellulaire altérées en cas de cancer, gènes essentiels de la biologie tumorale, du micro-environnement tumoral et de la réponse immunitaire y compris.

Immuno-oncologie

Neurosciences
  • Alzheimer’s Disease Panel : étude de l’expression des gènes liés à la maladie d’Alzheimer.
  • Glial Profiling Panel : étude complète de l’expression génique des astrocytes, des microglies et des oligodendrocytes, permettant une meilleure compréhension des maladies neurodégénératives et neuro-inflammatoires, et des neurotraumatismes.
  • Neuroinflammation Panel : étude complète de l’expression des gènes impliqués dans les voies, les processus et les types cellulaires impliqués dans la neuro-inflammation.
  • Neuropathology Panel : étude de l’expression des gènes impliqués dans 6 aspects fondamentaux de la neurodégénérescence : neurotransmission, interaction neurone-glie, neuroplasticité, intégrité de la structure cellulaire, neuro-inflammation et métabolisme.
Cellules souches/médecine régénérative
  • Stem Cell Characterization Panel : étude d’expression génique orientée vers le développement de thérapies à base de cellules souches.

Pour plus d’informations sur ce type d’études, contactez-nous :


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    Considérations en fonction du type d'échantillon de départ

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